Het Museumkwartier is ongeveer 45 hectare groot. Gezien de bijzondere ligging van de locatie in het hart van de Utrechtse Heuvelrug is er nadrukkelijk aandacht besteed aan het behoud en de ontwikkeling van natuurwaarden. Centraal op het terrein is het grootschalige museumcomplex gesitueerd. Het kwartier kent naast het hoofdgebouw tevens een depotgebouw en een tweetal opslaggebouwen, waarin onder andere collectiestukken die dienen voor demonstraties gestald worden. Op het terrein is een herdenkingsplein en een stiltetuin aanwezig. Hier is er ruimte voor herdenken en bezinning. Verderop bevindt zich een monument met een belangrijke historische waarde: het oudste gebouw in Nederland dat met de militaire luchtvaart te maken heeft. Het houten gebouw met torentje wordt momenteel volledig in originele staat hersteld. Op het grote omliggende buitenterrein is er ruimte voor evenementen.

In het nieuwe Nationaal Militair Museum komen eind 2014 de collecties van het Legermuseum in Delft en het Militaire Luchtvaartmuseum in Soesterberg samen. Het belang voor een optimaal binnenklimaat is voor het museum enorm. De conditie waarin eeuwenoude museumstukken bewaard worden is essentieel, maar ook voor de bezoekers is een aangenaam klimaat belangrijk. Het museumcomplex is dan ook voorzien van tal van duurzame technieken, waaronder betonkernactivering. Het toepassen van Uponor industrievloerverwarming op de begane grond en het TAB Omegaprofiel op de eerste verdiepingsvloer levert een grote bijdrage aan een optimaal binnenklimaat.